细胞是生物学的基本单位，研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。
单细胞测序相关研究与日俱增。该技术已广泛应用于科研行业神经生物学、种系传播、器官生长、癌症生物学等多个领域的研究。
单细胞测序行业发展现状调研
单细胞测序技术是指在单个细胞水平上，对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项技术。它能够揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态，反映细胞间的异质性，在肿瘤、发育生物学、微生物学、神经科学等领域发挥重要作用，正成为生命科学研究的焦点。
随着第二代测序(next generation sequencing，NGS)技术和第三代测序( third generation sequencing，TGS)技术的飞速发展，引起生物研究领域的巨大变革。
以前，需要从大量细胞中获取足够多的DNA进行测序，因此测序结果是这些细胞"整体"的表征。然而，由于细胞异质性，相同表型的细胞的遗传信息可能存在显著性差异，很多低丰度的信息会在整体表征中丢失。为了弥补传统高通量测序的局限性，单细胞测序技术应运而生。
在基因层面，单细胞测序可以获取更精准的遗传信息，在蛋白层面，通过分析单细胞表达的蛋白可以直接的获取人体免疫相关的靶点，用于免疫诊断、新药研发等。鉴于蛋白质不具有直接扩增的特性，以及蛋白质组学分析灵敏度的限制，单细胞蛋白分析的常见、有效技术是质谱分析，主要技术包括质谱流式细胞术(Mass Cytometry)、TOF-SIMS(飞行时间二次离子质谱仪)分析等。
质谱流式技术平台最初由美国DVS Science开发，但这家企业于2014年被美国Fluidigm以2.1亿美元收购。国内单细胞蛋白分析的代表企业为宸安生物、普罗亭，其中，宸安生物专注单细胞质谱流式诊断设备、试剂和软件开发，普罗亭致力于以单细胞蛋白层面研究为核心的检测服务。
据中研产业研究院《2023-2028年全球及中国单细胞测序行业发展现状调研及投资前景分析报告》分析：
无论是基因层面，还是蛋白层面，单细胞分析技术已然成熟，但囿于成本并未广泛应用于市场上，更多的是为科研提供服务。
目前，最常见的单细胞测序的应用是在肿瘤研究上。来自美国和英国的研究人员近日利用单细胞基因组扩增、测序和装配，从海洋样本中鉴定出一个单细胞细菌。单细胞测序方法即single cell sequencing(SNS)，能准确定量一个单细胞核中基因拷贝数目。由于癌细胞中基因组部分被删除，或者扩增，从而引起关键基因的缺失，或者表达过量，干扰正常细胞生长，因此利用这种方法就能分析基因拷贝数目，从而诊断癌症。