生物菌肥在农业上的作用已逐渐被人们所认识。现上已有70多个生产、应用和推广微生物肥料，我国也有250家企业年产约数十万吨微生物肥料应用于生产。这虽与同期化肥产量和用量不能相比，但确已开始在农业生产中发挥作用，取得了一定的经济效益和社会效应，已初步形成正规工业化生产阶段。
微生物菌肥作为高效能、低成本、生态环保的新型肥料，正逐渐进入大众视野，微生物菌肥种类繁多，产品形态各异，适用多种农作物，对于施用的土壤环境没有特殊要求，可以广泛适用于不同生态地区、不同种类的农作物。
在当前国家要求发展绿色农业、生态农业和可持续农业的背景下，微生物肥料具有广阔的应用前景。目前关于微生物肥料中多种微生物的作用机制尚未清楚，相关基础性研究严重欠缺。但随着分子生物学的不断发展，通过现代分子生物技术手段，深入探究我国微生物肥料的作用机理成为可能。
2023年生物菌肥行业市场发展前景分析
近年来，微生物菌肥逐渐被人们熟知和广泛使用，随着人们对微生物菌肥认识的提高，微生物菌肥在农业生产中的应用越来越广泛，尤其是在棚区。施用微生物菌肥,可以减少化肥施用量,明显起到改良土壤,降低生产成本,提高棚区蔬菜品质的作用。
微生物肥料是以微生物的生命活动导致作物得到特定肥料效应的一种制品，是农业生产中使用肥料的一种。其在我国已有近50年的历史，从根瘤菌剂——细菌肥料——微生物肥料，从名称上的演变已说明我国微生物肥料逐步发展的过程。
就中国市场而言，目前化学肥料市场规模在7000亿左右，有机肥市场规模在1200亿左右，合计超过8000亿元。在化肥零增长、绿色种植等政策影响之下，化学肥料和有机肥料呈现出一减一增的情况，化学肥料市场逐渐释放出份额，让位于有机肥，有机肥料成为了行业关键的增长引擎。
生物有机肥的开发应用不仅能为绿色农业、有机农业的发展创造条件，还能将有机废弃物“变废为宝”实现资源化利用，具有较高的经济效益、生态效益和社会效益，是实现农业可持续发展的有力保障。未来生物有机肥必将成为肥料行业生产和农资消费的热点，具有广阔的发展前景。