细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。
全球及中国单细胞测序行业发展现状 全球及中国单细胞测序行业投资前景分析
单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。
单细胞测序技术是指在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项技术。它能够揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性,在肿瘤、发育生物学、微生物学、神经科学等领域发挥重要作用,正成为生命科学研究的焦点。随着第二代测序(next generation sequencing,NGS)技术和第三代测序( third generation sequencing,TGS)技术的飞速发展,引起生物研究领域的巨大变革。
以前,需要从大量细胞中获取足够多的DNA进行测序,因此测序结果是这些细胞"整体"的表征。然而,由于细胞异质性,相同表型的细胞的遗传信息可能存在显著性差异,很多低丰度的信息会在整体表征中丢失。为了弥补传统高通量测序的局限性,单细胞测序技术应运而生。
根据中研普华产业研究院发布的《2023-2028年全球及中国单细胞测序行业发展现状调研及投资前景分析报告》显示:
单细胞测序技术是生命科学领域的一项革命性技术,可以细粒度地观察和刻画各个物种中组织、器官和有机体中单细胞分子图谱(细胞表达),便于更好地了解肿瘤微环境,以达到精细分析病因、精准匹配治疗方案的效果,对于“精准医疗”具有极高的应用价值。
值得注意的是,受数据样本量小、人工干预多、过度依赖marker gene(已报道的特异性基因)等因素的影响,单细胞测序细胞类型注释技术一直面临着泛化性、可解释性、稳定性均比较低的问题,现存的算法难以有更广泛的应用。
针对以上问题,论文中首次提出“基于大规模预训练语言模型的单细胞转录组细胞类型注释算法”,即“scBERT”模型,首次将“transformer”(自然语言处理算法经典计算单元)运用到单细胞转录组测序数据分析领域。
2019年9月,美国单细胞测序公司10x Genomics在纳斯达克上市,IPO3.9亿美元,成为该领域的领头羊。国内单细胞测序行业发展较为滞后,但也颇受资本青睐。2019年3月,万乘基因完成五百万元天使轮融资;6月,百奥智汇完成A轮融资,新格元生物完成近亿元pre-A轮融资;10月,寻因生物完成数千万元pre-A轮融资。